原子科學技術發展中心(簡稱原科中心)配合國家原子科學技術之發展，推動原子科學研究及原子能和平用途，擴大對社會之原子科技服務。除中心本部，並依任務特性不同下設反應器/同位素、保健物理及加速器等三個功能業務單位。各業務單位的工作任務如下：

• 中心辦公室(Office of the Center)
  負責對內溝通協調及一切對外行政工作，協助中心主任處理中心行政業務
• 反應器業務單位(Nuclear Reactor Lab)
  反應器教學訓練，教學參觀，學術實驗研究、同位素製造、中子照射、硼中子捕獲治療、非破壞性檢驗
• 同位素業務單位(Isotope Lab)
  學術實驗研究、教學參觀、同位素製造、鈷六十輻射照射、核醫藥物研發應用、微量元素分析，同位素推廣應用
• 保健物理業務單位(Health Physics Lab)
  教學參觀、學術實驗研究、輻射防護管制、人員劑量評估、全身加馬核種量測、環境試樣核種分析、輻射偵檢儀器校正、放射廢料管理
• 儀器業務單位(Instructmental Lab)
  教學參觀、學術實驗研究、加速器運轉與維護、離子束分析、離子束照射、材料分析、離子佈植、射束組裝